La synagogue d'Endingen, située dans la commune argovienne d'Endingen en Suisse, est un édifice historique qui reflète l'histoire unique des Juifs en Suisse. Jusqu'au milieu du XIXe siècle, Endingen et Lengnau, situés à 4 kilomètres l'un de l'autre, étaient les seuls villages où les Juifs pouvaient s'installer. Les premiers Juifs s'établissent à Endingen en 1678, après s'être installés à Lengnau dès 1622. Ne pouvant acquérir de terres, les Juifs d'Endingen exerçaient principalement des métiers de commerçants, colporteurs et négociants en bétail.

En 1850, la communauté juive des deux villages comptait 1 515 membres. Cependant, à partir de la moitié du XIXe siècle, ce nombre diminue rapidement. En 1920, seulement 263 Juifs vivent encore à Endingen et Lengnau, et en 1980, il ne reste plus que trois familles juives. Cette diminution s'explique par la possibilité de s'installer dans les grandes villes, entraînant un exode massif des familles.

La première synagogue d'Endingen, construite en 1764, devient vite insuffisante pour la communauté croissante. Une nouvelle synagogue, plus grande, est érigée entre 1850 et 1852. Sa façade en trois parties est surmontée d'un pignon en escalier, avec une horloge au-dessus de l'entrée, une particularité due à l'absence d'église avec clocher dans le village. Cette synagogue, unique lieu de prière d'Endingen, est aujourd'hui fermée et n'est utilisée que pour les fêtes ou les mariages. Les visites doivent être organisées à l'avance par l'intermédiaire de la communauté juive d'Argovie.