Lajoux est une commune du canton du Jura, nichée dans le district des Franches-Montagnes. Mentionnée pour la première fois en 1404 sous les noms de "La Jous Mertinatt" ou "La Joulz de Mertenait," elle est également connue sous la dénomination de "La Joux Mertenat." Le hameau de Fornet-Dessus, quant à lui, remonte à 1181.

Entre 1793 et 1815, Lajoux faisait partie du département français du Mont-Terrible, puis du Haut-Rhin. Suite au Congrès de Vienne en 1815, la commune a été rattachée au canton de Berne et incorporée dans le district de Moutier. Ce n'est qu'en 1975, lors des plébiscites jurassiens, que les habitants de Lajoux ont opté pour l'intégration dans le canton du Jura. Depuis le 1er janvier 1979, la commune fait partie du district des Franches-Montagnes.

Géographiquement, Lajoux est située à environ 11 kilomètres à l’est-nord-est de Saignelégier, dans la région de la Courtine de Bellelay. Ce territoire, d’une superficie de 12,38 km², inclut également les villages voisins de Bellelay, Châtelat, Monible et Sornetan, et contribue à la richesse du paysage jurassien.