Schaffhouse, chef-lieu du canton éponyme, est la plus grande commune du canton avec ses 36 600 habitants. Située sur la rive droite du Rhin, la ville est dominée par l’imposante forteresse de Munot et se distingue par son mélange unique d'architecture médiévale et de modernité industrielle. Les anciennes maisons à oriels témoignent de son riche passé, alors que Schaffhouse s'est transformée en un important centre industriel.

À proximité, mais en dehors de la ville, se trouvent les chutes du Rhin, l'une des plus grandes cascades d'Europe, ajoutant un attrait naturel à la région. Schaffhouse a une histoire fascinante ; au Moyen Âge, elle était une ville-État et a commencé à frapper sa monnaie dès 1045. L'abbaye bénédictine de Tous-les-Saints, fondée en 1049 par le comte Eberhard de Nellenburg, est un autre vestige de son passé prestigieux. Après avoir été ravagée par un incendie en 1376 et sous domination des Habsbourg, la ville a regagné son indépendance en 1415.

En 1529, Schaffhouse adopte la Réforme et ferme ses couvents. Le XIXe siècle voit l'industrialisation avec l'ouverture de la filature mécanique de coton en 1813 et la construction du chemin de fer vers Winterthour en 1857. Un incident tragique survint le 1er avril 1944 lorsqu'un bombardement américain accidentel fit une centaine de victimes, marquant un épisode douloureux dans l'histoire de la ville.